Kanal (channel)

Kanal (moleküler biyolojide), moleküler biyolojide intramoleküler kompartmanlarda ve hücreleri saran memebranlardaki detaylı gözenektir (por).

Kanallar (gözenekler), hücreler ve çevre arasında doğal bir bariyer olan biyolojik membranlar boyunca çeşitli substansları taşır (transport). Kanallar, boyutu 120 nm’ye kadar ulaşan protein kompleksler tarafından oluşturulur. Tiplerine bağlı olarak iç çapları 0.5 nm’den (iyon kanallar) 40 nm’ye (nükleer gözenekler) kadar değişebilir. Moleküler biyolojide ‘kanal’ terimim iyonları taşıyan yapıları, ‘por’ terimi büyük moleküllerin geçtiği yapıları tanımlar.

Kanallardaki geçiş, pasif (konsantrasyon gradyanı boyunca difüzyon) ve aktif (enerji kullanır) olabilir. Kanallar, genellikle transfer edilen substansların boyutuna seçicilik gösterirler. Boyut etkisine tipik bir örnek olarak sodyum ve potasyum katyonların transferindeki kanallar gösterilebilir; katyonların boyutları farklı olduğundan bazı kanallar potasyumu etkin bir şekilde taşırken sodyumu tutar. Tersine, sodyum katyonları taşıyan kanallar potasyum katyonların transportuna izin vermez. Kanallar ve gözenekler düzenlenmiş yapılardır; oluşumu, membran boyunca difüzyonu ve aktivitesi düzenlidir. Hücrelerin fizyolojisinde ve hücrealtı kompartmanlarda (çekirdekler, mitokondria, v.s.), ve hücre ölümünde önemli bir fonksiyonal rol oynarlar. Porların düzenliliği ve önemini gösteren tipik bir örnek, mitokondrial membran dışındaki kontrollü oluşumlarıdır.

Nanobiyoteknolojide kanallar, biyosensörlerin hazrlanmasında ve ilaç taşıyıcı sistemlerde ilacın kontrollü olarak bırakılmasını sağlayan cihazların geliştirilmesinde kullanılır. Şekilde bir iyon kanalın şeması verilmiştir: Bir transmembran protein dizisi (burada bir tetramer) bir fosfolipid membranda, spesifik sinyallere cevap olarak açılıp kapanan bir kanal oluşturur.



Bir iyon kanalın şematik tanımı